Анализ данных науки, образования и инновационной деятельности является очень сложной и комплексной проблемой. В публикации описан метод анализа паттернов и результаты его применения к проблеме анализа развития науки, образования и инновационной деятельности в регионах Российской Федерации. В результате исследования изучены характеристики регионов России по таким показателям, как уровень социально-экономических условий, потенциал и результативность науки, образования и инновационной деятельности в динамике за четыре года с 2007 по 2010 г. Получена классификация регионов по схожести внутренней структуры значений показателей, построены траектории развития регионов с течением времени и найдены группы регионов, придерживающихся одинаковой стратегии развития указанных показателей.