Рассматривается виды систем, участвующих в процессе управления предприятием, уточняются основные задачи управления информационной системой (ИС), для решения задачи синтеза структуры и параметров бизнес-процессов предприятия предлагается комплекс формальных моделей и методов их аналитического исследования, позволяющих осуществлять функционально-структурный синтез процессов, автоматически распараллеливать процессы, обеспечить их тестирование, оценивать качество процессов на основе комплекса критериев и соответствующих метрик.